研究报告

番茄JAZ家族生物信息学及表达模式分析  

黄思源上标1,2 , 樊若晨上标3 , 李婉容上标1 , 李建君上标1 , 高苗苗上标1 , 于晓惠上标1* , 陈银华上标1*
1海南大学,海南省热带生物资源可持续利用重点实验室,海口, 570228; 2海南大学园艺学院,海口, 570228; 3海南恩红农业科技有限公司,东方, 572600
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2022 年, 第 20 卷, 第 5 篇   
收稿日期: 2021年02月27日    接受日期: 2021年03月10日    发表日期: 2022年09月23日
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摘要

为明确番茄 JAZ家族成员的特征,本研究以番茄 JAZ家族基因为研究对象,对该家族成员的进化、复制、理化性质、表达模式等进行分析。结果显示,SlJAZs 主要分布在番茄的 7条染色体上,SlJAZ9SlJAZ10SlJAZ11 可能在 Chr.8上形成串联重复事件。SlJAZs 基因结构分析结果显示,内含子数目变异比较大,位于 1 (SlJAZ2)~14 (SlJAZ12)之间。启动子分析结果表明,13SlJAZs 基因启动子顺式作用元件种类和数量存在差异,推测其各自的功能也存在差异。组织表达模式分析表明,SlJAZs 基因在番茄在根、茎、叶、花、果间存在不同的表达特性。其中,SlJAZ2SlJAZ4SlJAZ6SlJAZ7SlJAZ8SlJAZ11SlJAZ12SlJAZ13 在花中表达量相对较高;SlJAZ5 在根中表达量相对较高;SlJAZ10在叶片和果中表达相对较高;SlJAZ11 在叶片中表达量相对较低,说明SlJAZs 基因可能在番茄发育的各个阶段发挥重要作用,本研究为进一步鉴定番茄 JAZ的功能提供了参考。
 

关键词
番茄;基因家族;JAZ;表达模式

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《分子植物育种》印刷版
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